Chim sẻ Dusky đầu tiên được phân loại là một loài vào năm 1873, sau khi phát hiện ra nó vào ngày 17 tháng 3 năm 1872 bởi Charles Johnson Maynard. Màu sắc tối của nó và giọng hót khác biệt là những gì tách nó như là một phân loài của những chú chim sẻ bên bờ biển khác. Được tìm thấy trong những đầm lầy thuộc bờ biển Đại Tây Dương của Florida trên đảo Merrit và trên sông St Johns, con chim sẻ màu hoàng đã được cô lập về mặt địa lý với những chú chim sẻ bên bờ biển khác.

Nó được phân loại như là một phân loài vào năm 1973. Mặc dù cấu trúc DNA của ty thể DNA sẫm màu giống như DNA ti thể của các quần thể chim ngân khác, nhưng thử nghiệm DNA tự nó không chứng minh rằng phân loại phân loài của nó là không xứng đáng. Năm 1981, chỉ còn lại năm chú chim sẻ hoàng hậu, tất cả đều là con đực. Những nỗ lực bảo tồn đã được thực hiện bằng cách cố gắng tạo ra những con non còn lại với những chú chim sẻ biển của Scott để tạo ra một nửa con lai nhưng đã không thành công.